La cappella di S.Pietro è situata all'interno di quello che un tempo era un carcere. L'ambiente superiore è il Carcere Mamertino, [metà II sec. a.C], quello inferiore è il Tullianum, risalente a poco prima dell'invasione gallica [ca 387 a.C]. Fu proprio qui, difatti, che vennero imprigionati e uccisi Vercingetoringe, Giugurta e i complici di Catilina, e dove venne tenuto prigioniero anche San Pietro. La cappella dedicata al santo fu costruita su richiesta del pontefice Paolo III.
Sopra alla struttura nel 1598 fu edificata la chiesa di S.Giuseppe dei Falegnami con uno stile che richiama le architetture di Giacomo della Porta. All'interno nella prima cappella 'La Sacra famiglia con S.Anna' di Giuseppe Ghezzi, nella cappella maggiore lo 'Sposalizio di Maria' di Horace Blanc, [1605] nella seconda cappella a sinistra 'La Natività' di Carlo Maratta [1651]